이전 글은 ‘단백질 디자인’ (Protein Design) 이라는 대부분의 사람들은 듣도 보도 못했을 용어를 던지고 끝났다. 그렇다면 단백질 디자인이 도대체 무엇인지부터 알아보도록 하자. 일단 이 연재에서 이야기하는 단백질 구조예측은 주어진 아미노산 서열로부터 단백질의 3차원 구조를 찾는 문제이고, 이를 위해서 이전에는 물리 화학적인 계산에 기반된 방법이 사용되다가 최근에는 알파폴드와 같은 인공지능 기반의 네트워크가 도입되어 탁월한 성능을 보였다는 것을 이미 이전의 연재에서 설명했다. 단백질 디자인은 단백질 구조예측의 ‘역함수’ 라고 생각하면 된다. 즉, 이미 정해진 단백질의 3차 구조를 형성할 수 있는 아미노산 서열을 찾는 문제이다. 여기서 단백질의 3차 구조란 자연계의 생물에서 발견되는 단백질일 수도 있고, 자연계에서는 아직 발견되지 않았지만 단백질의 접힘 원리를 따르는 임의의 모양의 단백질일수도 있다. 대부분의 과학-기술과 마찬가지로, 단백질 디자인은 처음에는...