남주는 자신이 유달리 신체능력이 좋다고 생각했을 뿐 자신의 돌아가신 아버지에 대해선 전혀 모르던 한 평범한 남학생일 뿐이었다. 그러나 심한 협박을 받게 되고 목숨이 위험에 처하게 되자 남주의 어머니는 독한 마음을 먹고 남주에게 아버지의 정체를 밝힌다. 그는 이가의 닌자였으며 평범한 주부였던 그녀는 남편의 죽음을 계기로 이가의 지위를 물려받아 살아왔다. 그러나 그의 목숨을 부지하기 위해선 닌자의 힘이 필요하다 판단한 그녀는 지체하지 않고 닌자 학교로 그를 보낸다. 갑작스럽게 학교의 친구들과 헤어지게 된 잇토키. 자칫 따를 당할 수 있는 위험에도 불구하고 그는 특유의 친화력으로 닌자 학교에서도 금방 친구들을 만든다. 그러나 이가에 대해 원한을 품고 있던 코우가 가문. 특히나 그 가문의 총아는 자신의 존경하...