박
0
글
0
팔로워
7
팔로잉

박희철

프로필 공유로 응원하기
남궁석
남궁석

소아마비 백신이 나오기까지 (하) - 생백신의 반격

생백신이렇게 소크의 백신이 미국 내에 소아마비 국립재단을 통하여 널리 접종되기 시작했지만, 소크 백신 개발 이전부터 약독화된 바이러스를 이용한 생 백신의 개발을 주장하던 알버트 사빈 (Albert sabin (1906–1993) 과 힐러리 코프로스키 (Hilary Kowprowsky) 등의 연구자들은 병원성이 없어진 바이러스를 이용한 백신 개발을 계속 진행했다.알버트 사빈 (Albert Sabin) 사빈 등의 생백신파들은 소크의 백신, 즉 바이러스를 키운 다음 이를 불활성화한 백신의 효과가 제한적이라고 주장했고, 대신 병원성이 없어진 살아 있는 바이러스를 사용하는 것이 최선이라고 주장했다. 사실 소크의 백신은 사빈 등의 연구자들의 주장대로 여러가지 한계가 있었다. 소크의 백신은 면역을 가지려면 최소 2번의 접종을 받아야만 했지만, 생백신의 경우 단 한번의 경구 투여, 즉 입으로 섭취하는 것만으로 면역이 가능하다. 그리고 병원성이 없어진 폴리오 바이러스 역시 소화기를 통하여...
우주/생명 · 산업/기술/IT
권
권석준의 테크어댑팅 인증된 계정

화웨이 7 nm 장벽 돌파의 함의 2: 예고된 장벽과 중국의 장기 계획

2018년, 애플이 아이폰 XS, XS max에 탑재될 모바일 AP인 A12칩을 TSMC의 1세대 7 nm 공정 (N7)으로 만들기 시작하던 시점, 중국의 통신 업체이자 모바일 기기 제조 업체였던 화웨이 역시 자사의 팹리스 회사인 하이실리콘이 설계한 기린 980 시리즈 AP를 제조한다는 것을 발표했다. 2018년은 아직 미국이 중국에 대해 반도체 기술 및 무역 제재를 본격화하기 전이었기 때문에 화웨이의 AP칩 제작은 TSMC에 위탁될 예정이었다. 기린 980이 타깃으로 삼은 공정은 애플이 활용한 TSMC의 DUV 멀티패터닝 기반 7 nm 공정 (N7FFF)이었고, 이어 화웨이는 조금 더 업그레이드된 버전의 AP인 기린 990 5G 시리즈칩을 TSMC의 EUV 기반 7 nm 공정 (N7FF+)에 위탁하고자 했다. 물론 당시 TSMC의 N7+ 공정 물량 중 모바일향 공정 대부분은 애플에 배정되어 있었으므로 화웨이의 AP는 화웨이가 원하는만큼 많이 생산되지는 않았다. 더구나 N7+ ...
국제정치/국제사회 · 산업/기술/IT · 경제/소비자
1
남궁석
남궁석

[분자생물학 역사 이야기] 1. 그리피스와 에이버리는 왜 폐렴균을 가지고 실험했을까?

앞으로 종종 광의의 '분자생물학' 의 역사에서 중요한 이야기, 그렇지만 상대적으로 대중들에게 많이 소개되지 않은 이야기들을 다루고자 한다. 첫번째로 다룰 이야기는 이 이야기이다. 이제는 고등학교 교과서 (생명과학 2) 에도 나오는 고전적인 실험이 있다. 바로 '그리피스의 실험' 과 '에이버리의 실험' 으로 불리는 실험으로써 유전 물질의 근원이 DNA 라는 것을 밝힌 고전적인 실험이다. 사실 분자생물학의 역사에서 왓&클 등등의 DNA 이중나선 모델 구축에 필적할 만큼 (어떤 의미에서는 더 중요할수도 있는) 중요한 이벤트이나 각종 과학 교양서에서 지겹게 다루어지고 있는 DNA 이중나선에 비해서는 다루어지는 빈도가 훨씬 적은 연구이기도 하다. "그리피스의 실험" (고등학교 생명과학 2 하이탑 생명과학) "에이버리의  실험" (고등학교 생명과학 2 하이탑 생명과학) 폐렴균에는 쥐에 독성을 나타내는 S형과 독성을 나타내지 않는 R형이 있는데, S형 균을 배양 후 이를 죽인...
산업/기술/IT · 우주/생명
1
남궁석
남궁석

[누구나 해보는 단백질 디자인] 4(완). 현실 세계에서 디자인된 단백질 만들기

지금까지 알아본 ‘단백질 디자인’ 은 모두 디지털 월드에서 벌어진 일이었다. 즉, 단백질 아미노산 서열이건 구조이건 결국 디지털의 신호로 존재하는 것이었고, 물리적인 형태의 실재하는 단백질을 만들어 과연 예상대로 디자인된 단백질이 작동하는지를 확인한 것은 아니었다. 그렇다면 이러한 디지털 공간의 단백질을 실존하는 화학 물질인 단백질로 만들어 그 특성을 조사하려면 어떻게 해야 할까? 물론 오늘날 실험생물학, 특히 단백질을 직접 만들어 실험하는 생화학, 구조생물학을 연구하는 연구자라면 잘 아는 내용이겠지만, 모든 사람들이 주어진 단백질 서열 정보를 어떻게 단백질로 만드는지를 잘 아는 것은 아니다. 일반인은 물론이고 연구자, 심지어 단백질 디자인이나 예측의 ‘디지털 도메인’ 즉 인실리코 (in sillico) 쪽에서 컴퓨터를 가지고 연구하는 연구자들이라면 이런 실험적인 분야에 지식이 부족할 수도 있다.물론 인실리코 위주의 연구자는 실험을 하는 웻 랩 위주의 연구자와 공동연구를 하...
산업/기술/IT
2
권
권석준의 테크어댑팅 인증된 계정

나무에서 반도체를 만들 수 있을까?

'반도체' 하면 사람들은 흔히들 실리콘을 생각한다. 틀린 말은 아니다. 우리가 알고 있는 반도체는 실리콘 웨이퍼에서부터 출발하기 때문이다. 물론 그 실리콘은 자연에서 채취하는 자원은 아니고 모래에서 출발한다. 모래의 주성분은 산화규소 (SiO2)이며, 산화규소를 환원하여 순수한 실리콘 결정을 만들고, 이를 얇게 자른 웨이퍼 위에 트랜지스터가 잔뜩 집적된 반도체 칩을 생산한다. 왜 반도체는 실리콘을 쓰게 되었을까? 실리콘은 탄소와 더불어 4족 원소, 즉, 결합을 4개 할 수 있는 원소라서 그럴까? 물론 그런 이유도 없잖아 있지만, 더 중요한 이유는 역설적이게도 SiO2, 즉, 앞서 언급한 산화규소를 자연적으로 형성할 수 있는 물질이기 때문이다. 좀 이상하게 들린다. 애초에 순수한 실리콘을 얻기 위해 산화규소 덩어리인 모래를 처리했던 것 아닌가? 그렇게 힘들게 얻은 실리콘을 왜 다시 산화규소로 돌린다는 것인가? 사실 순수한 실리콘은 산소를 만나면 표면이 얇은 피막으로 덮이는데,...
산업/기술/IT
5 1
남궁석
남궁석

DNA 이중나선 70년, 신화와 오해 - 왓슨/크릭은 프랭클린의 데이터를 훔친 것이 아니다

지금으로부터 70년 전, 1953년 4월 25일 네이처에는 3개의 논문이 백투백 (논문이 저널의 같은 호에 이어서 실리는 것) 으로 실렸다. 첫번째 논문은 캠브리지 대학의 왓슨과 크릭, 두번째는 런던 킹스 칼리지의 윌킨스,스토크스,윌슨의 논문, 세번째는 킹스 칼리지의 프랭클린과 고슬링의 논문이다. 왓슨, 크릭의 논문 윌킨스, 스토크스, 윌슨의 논문 프랭클린 & 고슬링의 논문 이 논문은 다름아닌 DNA 이중 나선의 모델과 이를 입증하는 실험 데이터에 관련된 논문이다. 학술지에 논문을 내본 사람이라면 알겠지만, 저널에 논문을 이렇게 백투백으로 내는 것은 비슷한 연구를 하던 연구자들이 비슷한 결론에 도달했을때, 사전에 합의하여 연구의 우선권을 공평하게 가지도록 (과학 연구에서 언제나 우선권은 제일 먼저 논문을 발표한 사람들에게 있으므로) 하는 관행이고, 실제로 이 논문들은 사전에 캠브리지 대학과 킹스 칼리지의 관련 연구자들에 의해 협의되어 나온 논문들이다. 이 논문...
우주/생명
1
남궁석
남궁석

[누구나 해보는 단백질 디자인] 3. 다른 단백질에 들러붙는 단백질 만들기

이전 연재에서는 동일한 단백질끼리 서로 결합하는 복합체를 만들고, 여기에 코로나 바이러스의 단백질을 결합해보았다. 결국 기존의 생물 유래의 단백질을 결합시키면 백신과 같은 역할을 할 수 있는 것은  기존의 생물 유래의 단백질이 다른 단백질과 결합할 수 있는 능력 때문이다. 그렇다면 생물이 기존에 가지고 있는 단백질에 결합할 수 있는 단백질을 디자인하여 기존 단백질의 기능을 조절할 수 있다면 좀 더 생명 현상에 밀접한 관계를 가지는 단백질을 만들 수 있지 않을까? 즉 질병에 관련하는 단백질에 결합하여 그 기능을 못하게 함으로써 질병의 진전을 막는 것과 같은 일을 할 수 있다. 사실 현재 시판되는 많은 ‘단백질 의약품’ 이라는 것들이 바로 이런 역할을 하는 것이다. 현재의 단백질 의약품들은 주로 항체 (Antibody) 기반의 의약품으로써, 외래 단백질이 들어오면 이를 무력화하기 위하여 여기에 결합할 수 있는 항체가 만들어지는 면역계의 원리를 이용한 것이지만, 단백질 디자...
산업/기술/IT
2
남궁석
남궁석

[누구나 해보는 단백질 디자인] 2. 인공 단백질에 기능을 불어넣기

이전 글에서는 RfDiffusion을 이용하여 세상에 없는 단백질을 하나 만들어 보는 과정을 알아보았다. 이렇게 단백질 디자인을 통하여 디자인된 단백질 역시 자연계에 발견되는 단백질처럼 단백질 생성 원리를 그대로 따르는 단백질이다. 그렇다면 이런 단백질은 생물체 내에서 어떤 기능을 할까? 이들은 자연계에서 존재하는 단백질과의 관계는 고려하지 않고 인공지능에 의해 아미노산 서열이 결정된 단백질이기 때문에, 만약 생물 속에 들어가도 어떤 특정한 생명 현상에 관여할 가능성은 그리 높지 않다. 사실 우리가 단백질에 관심을 가지는 주된 이유는 '생명체의 기본 부품' 으로써의 성질인데, 이러한 기능은 가지지 않을 가능성이 높은  '그냥 단백질' 인 셈이다. 그렇다면  생명체에서 어떤 실질적인 기능을 수행하는 단백질을 만들려면 어떻게 해야 할까? 이번 연재에서는 이전의 기본적인 디자인을 넘어서 조금 더 복잡한 단백질 디자인을 통해서 생명체에서 어떤 기능을 수행할 수 있는 단백질을 목...
산업/기술/IT
남궁석
남궁석

[누구나 해보는 단백질 디자인] 1. 자연계에 존재하지 않는 단백질 만들기

첨단의 연구 결과물을 직접 들여다보기 최신의 과학 연구 결과를 직접 접하는 것은 일반인 뿐만 아니라 과학자에게도 쉬운 일이 아니다. 여기서 ‘과학 연구결과를 직접 접한다’ 라는 의미는 언론 매체를 통해서 소개되는 연구 결과의 개요를 알게 된다는 의미가 아니다. 즉, 연구의 결과물인 데이터를 직접 들여다보거나 연구를 재현해 보는 등등, 연구 결과를 직접 체험해 보는 일이다. 어떻게 보면 언론 매체로 소개되는 최신의 연구 결과는 결국 최신 맛집을 방문하여 요리를 맛보고 쓴 기사나 인스타그램 포스팅과 비슷하다.  즉 대략적으로 연구가 어떤 것인지에 대한 소개는 될 수 있겠으나, 실제로 연구에서 나온 결과물을 들여다보거나, 비슷한 방법론으로 연구를 직접 수행해 보지 않은 상태에서 해당 연구를 완전히 이해했다고 이야기하기는 어렵다. 마치 인스타나 블로그, 혹은 유튜브 먹방만 보고서 맛좋은 음식을 체험했다고 하는 것 만큼이나 불완전한 일이라는 것이다.   그러나 물론 이것은 쉬...
산업/기술/IT
2
남궁석
남궁석

[학술 연구자를 위한 ChatGPT 활용] 3. ChatGPT 로 논문 읽기와 피어 리뷰 흉내

지난 연재에서는 의생명과학 학술 논문의 초록을 외부 데이터베이스에서 검색하고, 이를 기반으로 논문 형식의 글을 쓰는 방법을 알아보았다. 이번에는 논문을 ChatGPT 를 이용하여 ‘읽는’ 방법에 대해서 알아보도록 하자. 여기서 학술 논문을 읽는다는 것은 논문에서 제시한 내용을 이해하는 것을 넘어서, 논문의 핵심 주장을 파악하고, 이를 비판적으로 읽는 과정을 의미한다. 대부분의 출판물과 학술논문이 가지는 큰 차이라면 오늘날 거의 대부분의 학술 논문은 출판 전에 해당 분야 연구자에 의한 ‘피어 리뷰’ (동료 평가로 번역하는 것이 제일 적절하다) 를 거치고 여기서 나온 지적이나 비판을 보완하는 과정을 거친 이후에야 출판된다. 학계에서 권위가 있는 저널인 경우에는 내가 작성한 논문이 이러한 권위에 걸맞는 존재인지, 즉 논문 연구주제의 독창성과 연구 수행 방법의 엄밀성에 대해서 피어 리뷰를 통하여 혹독히 도전받는다. 그리하여 상당수의 논문들은 이러한 피어 리뷰의 문턱을 넘지도 못하...
산업/기술/IT
1