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scpsy2012

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남궁석
남궁석

DNA 이중나선 70년, 신화와 오해 - 왓슨/크릭은 프랭클린의 데이터를 훔친 것이 아니다

지금으로부터 70년 전, 1953년 4월 25일 네이처에는 3개의 논문이 백투백 (논문이 저널의 같은 호에 이어서 실리는 것) 으로 실렸다. 첫번째 논문은 캠브리지 대학의 왓슨과 크릭, 두번째는 런던 킹스 칼리지의 윌킨스,스토크스,윌슨의 논문, 세번째는 킹스 칼리지의 프랭클린과 고슬링의 논문이다. 왓슨, 크릭의 논문 윌킨스, 스토크스, 윌슨의 논문 프랭클린 & 고슬링의 논문 이 논문은 다름아닌 DNA 이중 나선의 모델과 이를 입증하는 실험 데이터에 관련된 논문이다. 학술지에 논문을 내본 사람이라면 알겠지만, 저널에 논문을 이렇게 백투백으로 내는 것은 비슷한 연구를 하던 연구자들이 비슷한 결론에 도달했을때, 사전에 합의하여 연구의 우선권을 공평하게 가지도록 (과학 연구에서 언제나 우선권은 제일 먼저 논문을 발표한 사람들에게 있으므로) 하는 관행이고, 실제로 이 논문들은 사전에 캠브리지 대학과 킹스 칼리지의 관련 연구자들에 의해 협의되어 나온 논문들이다. 이 논문...
우주/생명
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권
권석준의 테크어댑팅 인증된 계정

온난화에 의해 지구의 바다는 얼마나 팽창할까?

지구 기후위기에 따라 가장 큰 영향을 받는 지역은 역시 바다다. 특히 지구의 평균 기온이 상승함에 따라 해수면 역시 상승하고 있다. 많은 이들은 해수면 상승이 주로 극지방의 얼음이 녹으면서 발생한다고 생각하지만, 사실 꽤 높은 비율을 차지하는 것은 해수 자체의 열팽창 (thermal expansion)이다.해수는 크게 세 개의 층으로 구분된다. 평균 수심 200 m 까지의 영역은 혼합층 (평균 온도 17도)이다. 이 영역까지의 해수 온도는 큰 변동이 없고 일정하다. 그런데 혼합층 밑으로 내려가면 온도가 차갑게 변한다. 17도에서 4도로 급속하게 바뀌는 이 층을 수온약층 (thermocline, 수심은 200-1,000 m 사이)이라고 한다. 수온약층 밑으로 내려가면 다시 수온은 차가운 상태에서 크게 바뀌지 않는데, 대략 수심 1,000 m 이하의 이 층을 심해층이라고 부른다. 이 세 개 층의 구분은 지구 전지역에서 공통적으로 통용되는 것은 아니다. 위도마다 다르고, 같은 위도라...
기후/환경
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더 레이스
GPT4, 무엇에 쓰는 물건인고?
남궁석
남궁석

[학술 연구자를 위한 ChatGPT 활용] 1. ChatGPT의 출력을 어떻게 팩트 체크할 것인가?

ChatGPT가 화제가 된지도 어느정도 시간이 지났고, 이제 ChatGPT 를 어떻게 생산적으로 사용할 수 있을지에 대해서 관심이 모아지고 있다. 그러나 ChatGPT 를 제대로 사용하기 위해서는, 흔히 ChatGPT에 대해서 가지는 여러가지 오해와 기능의 한계를 정확히 인식해야 한다. 가장 대표적인 오해라면 ChatGPT 를 ‘자연어 문장으로 검색 가능한 검색 엔진’ 으로 착각하는 것이다. 그러나 ChatGPT가 뱉어내는 결과들을 조금이라도 유심히 들여다 본 사람이라면 그렇지 않다는 것을 눈치챘을 것이다. 앞으로 몇 회에 걸쳐서, 연구자가 ChatGPT 를 활용하여 연구에 관련된 문서 (논문, 결과보고서, 과제계획서 등등) 를 작성할 때 주의해야 할 부분, 그리고 ChatGPT가 잘 하는 부분, 그닥 잘 하지 못하는 부분, 절대 ChatGPT를 써서는 안되는 부분에 대해서 알아볼 것이다. 그리고 이러한 한계를 극복하여 ChatGPT 등의 대규모 언어 모델 기반의 인공지능 ...
산업/기술/IT · 얼룩소 더 레이스
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남궁석
[탈리도마이드에서 단백질 표적분해까지] 1. 탈리도마이드의 탄생
남궁석
남궁석

[탈리도마이드에서 단백질 표적분해까지] 2. 탈리도마이드의 비극

1957년 탈리도마이드가 시판된 이후 널리 사용된 지 오래지 않아 탈리도마이드가 생각처럼 안전한 약물이 아니라는 의심을 하게 하는 사례들이 보고되기 시작하였다.  1959년부터  탈리도마이드를 수면제 목적으로 사용한 환자들에게서 다발성 신경병증 (Polyneuropathy) 사례가 알려지기 시작하였다. 다발성 신경병증은 말초신경이 손상되어 발생하는 신경학적 장애로써 손발이 시리고 화끈거리며 통증이 발생하는 증상이다. 이러한 보고는 1960년 '영국의학저널' (The British Medical Journal) 에 처음 등장하였다. 제조사인 그뤼넨탈 역시 탈리도마이드 복용자로부터 빈번한 다발성 신경병증이 발생한다는 사실을 인지하였다.  만약 이때 그뤼넨탈이 약물을 리콜하거나 하다못해 일반의약품으로 판매되던 ‘콘테르간’ (탈리도마이드의 당시 상품명) 을 의사의 처방이 필요한 전문의약품화 했더라면 탈리도마이드에 의한 피해는 훨씬 줄어들었을 것이다. 그러나 그뤼넨탈은 약의 경고 문...
산업/기술/IT · 건강/보건
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남궁석
[알파폴드에서 단백질 디자인까지] 1. 단백질 구조는 왜 중요한가
남궁석
남궁석

[알파폴드에서 단백질 디자인까지] 10(완). 단백질 디자인 기술은 세상을 어떻게 바꿀까

지금까지 9화에 걸쳐 단백질 구조 예측과 디자인 기술이 어떻게 발전해 왔는지의 과정을 다루었다. 그렇다면 이러한 기술의 발전은 궁극적으로 어떤 변화를 만들까? 생명과학이나 바이오테크놀로지에 국한된 변화뿐만 아닌 넓은 관점에서의 예상을 해보도록 하자. 일단 지금까지 다룬 ‘단백질을 마음대로 만들어 낼 수 있다는 것’이 생물학의 역사에서 어떤 전환점이 되는지부터 알아보도록 하자. 읽는 생물학에서 쓰는 생물학의 시대로의 전환 지금까지의 생물학의 발전 과정을 살펴보면 대부분 생명 현상이라는 우주에서 가장 복잡한 현상을 어떻게 관찰하고 읽어내는 과정이었다고 할 수 있다. 즉 다양한 생물을 관찰하고, 이들을 해부하여 내부 구조를 파악하고, 현미경을 통해 세포라는 생물의 기본 단위를 발견하고, 세포를 구성하고 있는 화학 물질을 분석하고, 세포와 생물의 ‘펌웨어’ 라고 할 수 있는 유전 정보가 들어있는 DNA를 발견하여 그 안에 들어 있는 정보를 해독하고, DNA에 들어있는 정보 중 ...
산업/기술/IT
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권석준의 테크어댑팅 인증된 계정

지구의 자기장은 언젠가 사라질 수 있을까?

주의: 이글의 첫 부분에는 특정 영화에 대한 스포일러가 있습니다. 스포일러를 원치 않으시는 분은 두번째 단락부터 읽으시면 됩니다. 존 아미엘 감독, 애런 에크하트 주연의 SF 영화 '코어 (2003)'에서는 지구의 외핵이 모종의 원인 (스포: 원인은 사실 미 국방부의 지구급 확증 파괴 무기 DESTINI (Deep Earth Seismic Trigger INItiative)의 시험 가동으로 인한 인위적 부작용)으로 회전 운동을 멈추게 되어 지구 자기장에 문제가 생기고, 특히 지구로부터 우주로 뻗은 밴 앨런대 (Van Allen belt) 같은 천연 보호막 역할을 하던 지구 자기장이 점점 사라지면서 강력한 태양풍과 우주 방사선이 지구에 필터링 없이 그대로 입사하게 되어, 말 그대로 지구가 익어버릴 위험에 처해 멸망의 위기를 앞둔 절체절명의 상황을 다룬다. 결국 결자해지 한답시고 미국 정부는 지구 내부 깊숙이 파고 들어갈 수 있는, 언옵태니엄이라는 가상의 물질로 만들어진 탐사선을...
우주/생명
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권석준의 테크어댑팅 인증된 계정

과학적 사고 방식의 중요성: 보스니아 피라미드 이야기 1

최근 넷플릭스에는 그레이엄 핸콕 (Graham Hancock)이 제작에 참여한 다큐멘터리 '고대의 아포칼립스'가 공개되었다. 그레이엄 핸콕은 한 때 '신의 지문' 같은 책을 출판하면서 화제에 올랐던 인물로, 우리나라에도 그의 책이 몇 권 번역되어 꽤 인기를 끌었던 적이 있다. 나 역시 학창 시절, 그의 책을 구입하여 밤을 새가며 즐겁게 읽었던 기억이 난다. 핸콕의 책은 대부분 주류 역사학에서는 다루지 않는 혹은 대중에게 잘 알려져 있지 않은 세계 곳곳의 고대의 유적들을 취재하면서 그들 사이에 얽힌 관련성을 보고하는 스타일의 논픽션이라 볼 수 있다. 신의 지문 외에, 그는 우주의 지문 같은 후속작도 썼는데, 책들을 관통하는 주제는 '인류의 역사가 본격적으로 기록되기 전, 아주 오랜 옛날에는 (적어도 1만 2천년 전) 우리가 잊고 있는 초고대 문명이 존재했다.'로 수렴한다. 이러한 주제는 많은 사람들의 호기심을 불러일으켰으며 특히 어린 독자들로 하여금 수많은 상상의 나래를 펴게 하...
산업/기술/IT
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권석준의 테크어댑팅 인증된 계정

일본의 반도체 권토중래의 꿈 (FIN): 래피더스의 예정된 결말, 그리고 숨겨진 반전의 요소

지난 글에서는 일본의 래피더스의 미래가 밝지 않음을 이야기했다. 기술적 격차는 물론, 반도체 제조업의 특성상 초기에 들어가는 막대한 시설투자비용 (CAPEX)을 조달할 방법이 마땅치 않기 때문이다. 반도체 제조업은 흑자와 적자 모두 언제든 대규모로 발생할 수 있는데 수백, 수천 억원 규모의 적자가 연속으로 발생하기 시작하면 시장점유율 하락은 물론 벌어지는 기술 격차를 따라잡을 가능성이 작아진다. 그리고 종국에는 자의반타의반 구조조정의 격류에 휩싸이는 일이 반복적으로 발생할 수 있다. 물론 이는 한국 기업이라고 해서 예외는 아니다. 다만 래피더스는 이미 일본이 과거 반도체 산업의 구조조정의 실패 사례가 명확한 레퍼런스로 존재하고 있다는 것, 그리고 그것을 답습할 가능성이 높다는 것이 눈에 띄는 위험 요소이기도 하다. 일본 정부는 1970년대 두 차례의 오일쇼크를 겪으며 제조업 구조의 재편을 계획했는데, 국가 차원에서 차세대 전략 산업으로 선택된 것 중 하나가 반도체 산업이었다...
산업/기술/IT
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권석준의 테크어댑팅 인증된 계정

일본의 반도체 권토중래의 꿈: 래피더스의 한계

지난글 (https://alook.so/posts/latO6l3) 에서는 일본이 최근 미국 IBM과 협력하여 출범시킨 반도체 연합 기업 래피더스에 대한 이야기를 했다. 자본금 770억엔 규모로 출범한 이 회사에 미래는 있을까? 이 회사의 구조적 문제는 무엇일까? 그것은 자본과 기술의 문제에 국한된 것일까? 래피더스가 앞으로 몇 년 안에 2 나노 공정에 바로 뛰어들 수 있는 자본과 기술적 여건이 형성되었다 가정해 보자. (물론 가혹한 가정이긴 하다) 하지만 그렇다고 해도 제대로 제때 양산이 이루어질 것인지는 별개의 문제다. 즉, 충분히 경제성 있는 수율이 확보될 수 있는지가 더 중요한 문제가 될 수 있다는 뜻이다. 현재 GAAFET, MBCFET 같은 2 나노 이하급 초미세 공정에 활용되는 차세대 FET (전계효과트랜지스터) 구조의 집적 공정에 대한 특허는 TSMC와 삼성전자, 그리고 IBM이 대부분 가지고 있다. 이를 피해 IBM의 특허 받은 구조를 비롯, 다른 구조의 트랜지...
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남궁석
남궁석

[알파폴드에서 단백질 디자인까지] 1. 단백질 구조는 왜 중요한가

최근 몇 년 동안 생명과학계에서 일어난 사건 중 가장 혁신적인 일은 무엇일까? 딥마인드 (DeepMind) 가 개발한 인공지능인 알파폴드 (Alphafold) 에 의한 단백질 구조 예측은 생명과학에 조금이라도 관심이 있는 사람이라면 절대 빼놓을 수 없는 일대 사건이다. 실제로 인공지능에 의한 단백질 구조 예측은 네이처와 사이언스 등의 과학 잡지에서 공히 2021년의 과학 뉴스로 꼽히곤 했다. 그러나 단백질 구조 예측 이외에도 인공지능은 단백질 디자인 (Protein Design)과 같이 아직은 일반에게는 그리 생소하지 않은 분야에서도 혁신을 만들어내고 있다. 그러나 일반인들에게는 과연 인공지능이 단백질 구조를 예측한다는 것이 어떤 의미이며, 어떻게 중요한지에 대해서 잘 와닿지 않는듯 하다. 반면 몇년 전의 알파고 (AlphaGo) 때는 곧 인공지능이 모든 것을 해결해 줄 거야 식의 엄청난 반응을 이끌어 냈음에도 불구하고 말이다. 참고로 딥마인드 자신들은 알파폴드의 업적을 여...
산업/기술/IT
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권석준의 테크어댑팅 인증된 계정

일본의 반도체 권토중래의 꿈: 래피더스의 출범, 그리고 그 미래

지난 글 (https://alook.so/posts/XBto5RE?fbclid=IwAR0LxqNs4x4M6Yiaw5whJ0rPJsld4GPUwsF8_TpR-HkPKNJHVV4Ws-D7Uqo) 에서는 2나노 반도체로의 로드맵이 비교적 예측 가능한 수준에서 시장의 리더들에 의해 정해진 상황임을 설명했다. 현재로서는 5 나노 이하의 초미세 공정 기반으로 반도체칩을 제조할 수 있는 회사는 TSMC와 삼성전자밖에 없고, 앞으로도 이 구도는 변동이 없을 것처럼 보인다. 그렇다면 이에 대항하는 새로운 경쟁자가 나올 가능성이 있을까? 일본 정부는 지난 2022년 7월 흥미로운 소식을 발표했다. 미국과 일본이 2 나노 공정 연구 개발 센터를 공동으로 설립한다는 소식이었다. 이에 참여하는 일본 측 파트너는 일본의 대표적인 국립연구소인 물리화학연구소 (리켄)과 동경대이며 미국 측 파트너는 IBM이다. 양국은 2 나노 공정을 단순히 연구 차원에서만 그치는 것이 아니라, 아예 양산까지 연결한다는 계...
산업/기술/IT
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권
권석준의 테크어댑팅 인증된 계정

일본의 반도체 권토중래의 꿈: 2 나노 반도체 프로젝트의 의미

지난 2022년 9월, ASML의 CTO인 마틴 반 덴 브링크 (Martin van den Brink)는 현재 방식의 노광기술 (lithography)는 조만간 한계에 봉착할 것임을 밝힌 바 있다. 이제는 많은 사람이 알고 있듯 ASML은 2023년 1월 현재, 전 세계에서 유일하게 극자외선 (EUV, Extrene UV) 노광기를 생산-공급하는 회사다. 이 EUV 노광기는 반도체 제조 공정 중 이른바 선공정 (FEOL, Front-end-of-line)에서 가장 핵심적인 단계인 패터닝 (patterning) 과정에 있어 필수적인 장비다. 그리고 애플의 아이폰이나 맥북에 들어가는 M1, M2칩, AMD의 최신 CPU인 라이젠 7000 시리즈, 엔비디아의 4080 시리즈 GPU, 그리고 퀄컴의 AP인 차세대 스냅드래곤 같은 첨단 반도체칩 생산에 있어서는 더더욱 필수적인 장비다. 애플, AMD, 퀄컴, 엔비디아, 구글 같이 자체적인 칩을 설계하는 팹리스 회사들로부터 위탁받아 반도체...
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