정진원
방탕중년단
알파폴드 3 - 오픈소스로부터 비공개 소프트웨어로의 변화
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[알파폴드에서 단백질 디자인까지]9. 단백질이 스테블 디퓨전과 ChatGPT 기술이 만날 때
[알파폴드에서 단백질 디자인까지]9. 단백질이 스테블 디퓨전과 ChatGPT 기술이 만날 때
인공지능에서 최근 대중들에게 가장 화제가 된 것들은 무엇보다도 생성 AI (Generative AI) 로 불리는 기술들이다. 가령 정해진 텍스트에 따라서 학습된 이미지에 기반하여 마치 프로 아티스트가 그린 듯한 고퀄리티의 그림을 생성해 주는 DALL·E-2 나 스태블 디퓨전 (Stable Diffusion), 그리고 화자의 질문에 따라서 적절한 답을 주는 ChatGPT 등은 매우 큰 화제가 되고 있다.
그러나 이러한 AI 응용기술과 크게 다르지 않은 원리가 최근 단백질 분야에 활발히 적용되고 있다는 것은 일반인들에게 아직 잘 알려져 있지 않은 듯 싶다. 그것도 그럴 것이 생성 AI 가 만들어 낸 디지털 이미지나 텍스트는 바로 눈으로 보고 그 대단함을 바로 느낄 수 있지만, 단백질 디자인에 의해 생성된 단백질 서열이나 구조는 그것만으로는 큰 영향력을 미치기는 힘들고, 실존하는 단백질이 되어 의약품 등으로 그 효과가 검증되기까지는 앞으로도 꽤 오랜 시간이 걸릴 것이라는 차이가 ...
[알파폴드에서 단백질 디자인까지] 5. 알파폴드는 과학 연구에 어떤 영향을 미쳤나
[알파폴드에서 단백질 디자인까지] 5. 알파폴드는 과학 연구에 어떤 영향을 미쳤나
(글쓴이 주 : 이제부터는 2021년에 공개된 딥마인드의 두번째 알파폴드를 ‘알파폴드’ 로 칭하니 주의 바랍니다)
알파폴드가 놀라운 성능으로 단백질 구조를 예측가능하다는 것은 CASP 14 결과가 공개된 2020년 12월에 처음 알려졌지만, 알파폴드 의 전모가 공개된 것은 2021년 7월, 딥마인드가 알파폴드에 대한 논문을 발표하고, 알파폴드의 소스 코드를 오픈소스로 공개하여 누구나 실행시켜 볼 수 있도록 한 이후였다. 그 직후 전세계의 구조생물학자 및 계산생물학자들은 알파폴드의 세부적인 부분까지 뜯어보면서 과연 알파폴드가 어느 정도의 성능인지를 확인하였다.그림 1 : 알파폴드는 2021년 7월 오픈 소스로 누구나 수행해 볼 수 있도록 코드가 완전 공개되었다.
그 결과 알파폴드는 딥마인드가 이미 공개한 것처럼 높은 수준의 정확도로 구조를 예측할 수 있었다. 또한 구조 예측을 하는데는 처음 우려한 것처럼 엄청난 컴퓨터 리소스가 필요한 것도 아니라는 것이 밝혀졌다. 수백만...
[알파폴드에서 단백질 디자인까지] 4. 알파폴드의 충격
공고는 함정이다! -"기술 배워라"던 어른들은 책임지지 않았다